MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci 6BC chromosome

Total Repeats: 24892

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015470	GTT	2	6	25	30	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015470	AGA	3	9	75	83	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015470	TA	3	6	93	98	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015470	CGA	2	6	170	175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332286960
5	NC_015470	AGA	2	6	188	193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332286960
6	NC_015470	CTT	2	6	225	230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332286960
7	NC_015470	T	7	7	256	262	0 %	100 %	0 %	0 %	332286960
8	NC_015470	AAGG	2	8	266	273	50 %	0 %	50 %	0 %	332286960
9	NC_015470	A	6	6	274	279	100 %	0 %	0 %	0 %	332286960
10	NC_015470	GT	3	6	309	314	0 %	50 %	50 %	0 %	332286960
11	NC_015470	TCT	2	6	331	336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332286960
12	NC_015470	A	7	7	478	484	100 %	0 %	0 %	0 %	332286960
13	NC_015470	TG	3	6	498	503	0 %	50 %	50 %	0 %	332286960
14	NC_015470	TAT	2	6	553	558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332286960
15	NC_015470	ATG	2	6	579	584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332286960
16	NC_015470	GCGT	2	8	588	595	0 %	25 %	50 %	25 %	332286960
17	NC_015470	TGT	2	6	640	645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332286960
18	NC_015470	ATG	2	6	659	664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332286960
19	NC_015470	TC	3	6	727	732	0 %	50 %	0 %	50 %	332286960
20	NC_015470	ACA	2	6	950	955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332286960
21	NC_015470	AGC	2	6	964	969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332286960
22	NC_015470	GTG	2	6	981	986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332286960
23	NC_015470	AGC	3	9	1000	1008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332286960
24	NC_015470	CTA	2	6	1011	1016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332286960
25	NC_015470	GGT	2	6	1020	1025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332286960
26	NC_015470	CTT	2	6	1128	1133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332286960
27	NC_015470	TTC	2	6	1146	1151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015470	GAA	2	6	1152	1157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015470	CTT	2	6	1225	1230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332286961
30	NC_015470	AC	3	6	1295	1300	50 %	0 %	0 %	50 %	332286961
31	NC_015470	TTAA	2	8	1353	1360	50 %	50 %	0 %	0 %	332286961
32	NC_015470	ACA	2	6	1365	1370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332286961
33	NC_015470	ATG	2	6	1413	1418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332286961
34	NC_015470	GT	3	6	1461	1466	0 %	50 %	50 %	0 %	332286961
35	NC_015470	TTA	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332286961
36	NC_015470	TAG	2	6	1576	1581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332286961
37	NC_015470	TC	3	6	1584	1589	0 %	50 %	0 %	50 %	332286961
38	NC_015470	TAG	2	6	1714	1719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332286961
39	NC_015470	CTA	2	6	1768	1773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332286961
40	NC_015470	TTC	2	6	1789	1794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332286961
41	NC_015470	TG	3	6	1888	1893	0 %	50 %	50 %	0 %	332286961
42	NC_015470	ATA	2	6	1989	1994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332286961
43	NC_015470	CTT	2	6	2056	2061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332286961
44	NC_015470	GAA	2	6	2067	2072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332286961
45	NC_015470	TGA	2	6	2128	2133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332286961
46	NC_015470	GAT	2	6	2146	2151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332286961
47	NC_015470	GTT	2	6	2182	2187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332286961
48	NC_015470	CTT	2	6	2206	2211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332286961
49	NC_015470	T	6	6	2210	2215	0 %	100 %	0 %	0 %	332286961
50	NC_015470	T	8	8	2289	2296	0 %	100 %	0 %	0 %	332286961
51	NC_015470	TAA	2	6	2368	2373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332286961
52	NC_015470	GAA	2	6	2415	2420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332286961
53	NC_015470	AGAT	2	8	2543	2550	50 %	25 %	25 %	0 %	332286961
54	NC_015470	T	8	8	2617	2624	0 %	100 %	0 %	0 %	332286962
55	NC_015470	T	8	8	2629	2636	0 %	100 %	0 %	0 %	332286962
56	NC_015470	AGT	2	6	2643	2648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332286962
57	NC_015470	TTA	2	6	2656	2661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332286962
58	NC_015470	TCC	2	6	2685	2690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332286962
59	NC_015470	T	6	6	2730	2735	0 %	100 %	0 %	0 %	332286962
60	NC_015470	TTC	2	6	2778	2783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332286962
61	NC_015470	GA	3	6	2786	2791	50 %	0 %	50 %	0 %	332286962
62	NC_015470	TTA	2	6	2803	2808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332286962
63	NC_015470	TGTT	2	8	2841	2848	0 %	75 %	25 %	0 %	332286962
64	NC_015470	T	6	6	2885	2890	0 %	100 %	0 %	0 %	332286962
65	NC_015470	T	6	6	2897	2902	0 %	100 %	0 %	0 %	332286962
66	NC_015470	AGA	2	6	2934	2939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332286962
67	NC_015470	GAAG	2	8	2952	2959	50 %	0 %	50 %	0 %	332286962
68	NC_015470	TAT	2	6	2972	2977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332286962
69	NC_015470	AGTA	2	8	2982	2989	50 %	25 %	25 %	0 %	332286962
70	NC_015470	TAT	2	6	3006	3011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332286962
71	NC_015470	T	6	6	3011	3016	0 %	100 %	0 %	0 %	332286962
72	NC_015470	TAT	2	6	3058	3063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015470	ATT	3	9	3073	3081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015470	TGT	2	6	3086	3091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015470	T	6	6	3102	3107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015470	GAA	2	6	3217	3222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332286963
77	NC_015470	TTTG	2	8	3300	3307	0 %	75 %	25 %	0 %	332286963
78	NC_015470	TCCT	2	8	3326	3333	0 %	50 %	0 %	50 %	332286963
79	NC_015470	GA	3	6	3340	3345	50 %	0 %	50 %	0 %	332286963
80	NC_015470	GAAAA	2	10	3356	3365	80 %	0 %	20 %	0 %	332286963
81	NC_015470	ATG	2	6	3422	3427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332286963
82	NC_015470	AGT	2	6	3489	3494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332286963
83	NC_015470	CTT	2	6	3543	3548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332286963
84	NC_015470	CAA	2	6	3628	3633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332286963
85	NC_015470	ATG	2	6	3661	3666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332286963
86	NC_015470	ATC	2	6	3779	3784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332286963
87	NC_015470	TGG	2	6	3892	3897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332286963
88	NC_015470	AGA	2	6	4143	4148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332286963
89	NC_015470	T	6	6	4191	4196	0 %	100 %	0 %	0 %	332286963
90	NC_015470	TAA	2	6	4209	4214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332286963
91	NC_015470	AT	3	6	4227	4232	50 %	50 %	0 %	0 %	332286963
92	NC_015470	GAA	2	6	4246	4251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332286963
93	NC_015470	AGC	2	6	4284	4289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332286963
94	NC_015470	TAA	2	6	4313	4318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332286963
95	NC_015470	AGGAG	2	10	4413	4422	40 %	0 %	60 %	0 %	332286963
96	NC_015470	AGA	2	6	4433	4438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332286963
97	NC_015470	CTT	2	6	4450	4455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332286963
98	NC_015470	ATG	2	6	4474	4479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332286963
99	NC_015470	GAT	2	6	4525	4530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332286963
100	NC_015470	GCT	2	6	4579	4584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332286963
101	NC_015470	CT	3	6	4729	4734	0 %	50 %	0 %	50 %	332286963
102	NC_015470	GAA	2	6	4809	4814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332286963
103	NC_015470	CTGTGG	2	12	4820	4831	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	332286963
104	NC_015470	AAG	2	6	4832	4837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332286963
105	NC_015470	TGG	2	6	4910	4915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332286963
106	NC_015470	AAG	2	6	5009	5014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332286963
107	NC_015470	AGA	2	6	5112	5117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332286963
108	NC_015470	TTA	2	6	5132	5137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332286963
109	NC_015470	CAA	2	6	5220	5225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332286963
110	NC_015470	GAAA	2	8	5255	5262	75 %	0 %	25 %	0 %	332286963
111	NC_015470	CAA	2	6	5338	5343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015470	TTG	2	6	5349	5354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015470	AATC	2	8	5414	5421	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_015470	T	7	7	5457	5463	0 %	100 %	0 %	0 %	332286964
115	NC_015470	AGA	2	6	5520	5525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332286964
116	NC_015470	CGAG	2	8	5526	5533	25 %	0 %	50 %	25 %	332286964
117	NC_015470	TGG	2	6	5586	5591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332286964
118	NC_015470	TAT	2	6	5621	5626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332286964
119	NC_015470	GTT	2	6	5667	5672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332286964
120	NC_015470	CAA	2	6	5683	5688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332286964
121	NC_015470	GAT	2	6	5710	5715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332286964
122	NC_015470	TGT	2	6	5730	5735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332286964
123	NC_015470	GGA	2	6	5752	5757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332286964
124	NC_015470	T	6	6	5786	5791	0 %	100 %	0 %	0 %	332286964
125	NC_015470	CAA	2	6	5863	5868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332286964
126	NC_015470	TGA	2	6	5925	5930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332286964
127	NC_015470	GAT	2	6	5931	5936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332286964
128	NC_015470	TGT	3	9	5983	5991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332286964
129	NC_015470	TGA	2	6	6047	6052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332286964
130	NC_015470	GCT	2	6	6063	6068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332286964
131	NC_015470	T	7	7	6072	6078	0 %	100 %	0 %	0 %	332286964
132	NC_015470	TGC	2	6	6222	6227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332286964
133	NC_015470	TGA	2	6	6243	6248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332286964
134	NC_015470	GAA	2	6	6274	6279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332286964
135	NC_015470	A	6	6	6278	6283	100 %	0 %	0 %	0 %	332286964
136	NC_015470	GAG	2	6	6287	6292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332286964
137	NC_015470	TTC	2	6	6297	6302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332286964
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403	NC_015470	CTG	2	6	19163	19168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332286972
404	NC_015470	GTTT	2	8	19263	19270	0 %	75 %	25 %	0 %	332286972
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